On vuosi 1964, ja eletään kylmän sodan kiihkeimpiä vuosia. Naked Snake, vastaperustettujen FOX-erikoisjoukkojen agentti, suuntaa Neuvostoliittoon auttaakseen venäläistä tiedemiestä pakenemaan länteen. Snaken ohjaaja The Boss, maailman erikoisjoukkojen äitinä tunnettu naissotilas, loikkaa kuitenkin Neuvostoliittoon ja vie mukanaan pienikokoisen ydinkärjen. Asetta käytetään pian venäläiseen tutkimuskeskukseen, ja maailma päätyy sodan partaalle. Snaken on palattava Neuvostoliittoon surmaamaan entinen ohjaajansa ja estämään ydinsota.
• Mukana MGS3 sekä alkuperäiset MG1 ja MG2.
• Koe historian tapahtumat uudelleen, kun geopoliittinen tilanne muuttuu.
• Päihitä viholliset lähitaisteluissa, hiipimällä, kuulustelemalla, kiipeämällä, metsästämällä, käyttämällä valepukuja ja hoitamalla vammoja.
• Liiku ympäristössä, jossa ansoihin jäävät niin viholliset kuin saaliskin ja varjoissa piilee uhkia.
• Upean taustamusiikin on säveltänyt Harry Gregson-Williams (Armageddon, The Rock).
1 pelaaja Vähintään 675 Kt tilaa HDTV:n näyttöresoluutio: 720p DUALSHOCK®3-värinätoiminto