Flynn, um jovem pirata, decide embarcar-se numa trepidante aventura em procura do mais legendario dos tesouros: A espada do Capitão Freckles. No entanto, a espada está possuída pelo espírito do Capitão e juntos deverão enfrentar à maldição que pesa sobre o tesouro.
Flynn & Freckles é um jogo para um jogador, em terceira pessoa, com um grande componente de exploração e combate. Como Flynn deveremos ir superando diferentes níveis de plataformas, puzzles e combatendo contra múltiplos inimigos.
F&F dá-nos a oportunidade de voltar desfrutar de um jogo de plataformas 3D ao mais puro estilo dos 90 com um renovado apartado artístico e técnico e todo isso envolvido numa ambientación pirata fantástica.